Schrödinger Suite یکی از پیشرفتهترین و معتبرترین مجموعههای نرمافزاری در حوزهٔ شیمی محاسباتی بهشمار میرود که توسط کمپانی خوشنام Schrödinger ارائه شده است. این نرمافزار راهکارهایی جامع و یکپارچه برای پژوهشهای علوم زیستی و علوم مواد فراهم میکند و با بهرهگیری از دقیقترین مدلسازیهای محاسباتی، توانسته است جایگاه برجستهای در میان ابزارهای طراحی ترکیبات شیمیایی و مولکولهای زیستی بهدست آورد.
هدف اصلی از توسعهٔ مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite، توانمندسازی پژوهشگران در سراسر جهان برای پیشبرد اهداف پژوهشی در راستای ارتقای سلامت انسان و بهبود کیفیت زندگی، از طریق بهکارگیری تکنیکهای نوین محاسباتی و مدلسازی مولکولی است. این مجموعهٔ نرمافزاری با تکیه بر فناوریهای علمی پیشرفته و همکاری با مراکز پژوهشی و صنعتی بینالمللی، به پژوهشگران کمک میکند تا فرایند تحقیق و توسعه را با سرعت بیشتری طی کنند، هزینههای مربوطه را کاهش دهند و به کشفهای علمی نوینی دست یابند که در شرایط عادی امکانپذیر نیستند.
مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite در زمینهٔ طراحی دارو از هر دو رویکرد لیگاند-محور و ساختار-محور بهره میبرد و با استفاده از مدلهای پیشبینیکنندهٔ بسیار دقیق، امکان ارزیابی ویژگیهای ترکیبات شیمیایی را در مراحل اولیهٔ فرایند کشف دارو فراهم میسازد. بهکمک این توانایی منحصربهفرد، دانشمندان قادر خواهند بود ترکیبات دارویی را با ویژگیهای بهینه انتخاب کرده و فرایند انتخاب، طراحی و بهینهسازی ترکیبات نوین را با دقت بالاتری انجام دهند. دقت و قابلیت اطمینان فناوریهای محاسباتی این مجموعهٔ نرمافزاری، آن را به ابزاری کلیدی در حل مسائل واقعی حوزهٔ تحقیقات علوم زیستی بدل کرده است.
از جمله تواناییهای قابلتوجه این مجموعه، ارائهٔ راهکارهای جامع برای کشف و بهینهسازی ترکیبات پیشساخته (Lead) است که اعتبار آن از طریق نتایج موفقیتآمیز بهدستآمده توسط همکاران تحقیقاتی در اهداف پژوهشی گوناگون تأیید شده است. این مجموعهٔ نرمافزاری در حوزهٔ علوم مواد نیز با انجام شبیهسازیهای دقیق مولکولی، امکان طراحی مواد جدید و پیشرفتهای را فراهم میکند که نقشی حیاتی در زندگی مدرن ایفا میکنند.
مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite قابلیت طراحی مولکولهای زیستی قابل توسعه با ویژگیهای کاملاً بهینه را نیز در اختیار کاربران قرار میدهد و با استفاده از روشهای پیشبینی پیشرفته، به پژوهشگران این امکان را میدهد که از مرحلهٔ توالی تا ساختار نهایی مولکولها، عملکرد آنها را بهطور هدفمند و دقیق طراحی و تنظیم کنند. بهعلاوه، با فراهمسازی گردشکارهای مبتنی بر فیزیک محاسباتی و بهرهگیری از محیطی کاربرپسند برای نمایش ساختارها و انجام مدلسازیهای پیشرفته، این مجموعه شرایطی فراهم میآورد تا فرایند طراحی زیستداروها و مولکولهای پیچیده در بستری مدرن و کارآمد صورت بگیرد.
برخی از ویژگیها و امکانات مهم این مجموعهٔ نرمافزاری
● ابزارهای شبیهسازی کارآمد: مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite تعداد بسیار زیادی از انواع ابزارهای شبیهسازی پیشرفته و قدرتمند را جهت طیف وسیعی از کاربُردها در اختیار کاربران قرار میدهد.
● قابلیتهای موازیسازی: مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite از قابلیتهای موازیسازی پیشرفته برای تسریع شبیهسازیها بر روی پلتفرمهایی چون رایانههای چندهستهای استفاده میکند.
● کتابخانههای جامع: مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite شامل کتابخانههای جامعی از ساختارهای مولکولی، دادههای تجربی و پارامترهای شبیهسازی است.
● رابط کاربری گرافیکی: مجموعهٔ نرمافزاری Schrödinger Suite رابط کاربری گرافیکی بصری و آسانی دارد که استفاده از آن را برای کاربران با سطوح مختلف تجربه و مهارت، آسان میکند.
برخی از کاربردهای مهم این مجموعهٔ نرمافزاری
● طراحی دارو: مجموعهٔ نرمافزاری Schrodinger Suite میتواند برای طراحی و بهینهسازی داروهای جدید با استفاده از روشهای شبیهسازی مولکولی دینامیکی و داکینگ لیگاند استفاده شود.
● کشف مواد: مجموعهٔ نرمافزاری Schrodinger Suite میتواند برای کشف مواد جدید با خواص مطلوب با استفاده از روشهای شبیهسازی مانند شبیهسازیهای مونت کارلو و دینامیک مولکولی استفاده شود.
● نانوتکنولوژی: مجموعهٔ نرمافزاری Schrodinger Suite میتواند برای شبیهسازی نانوذرات و نانوساختارها برای مطالعهٔ خواص و رفتار آنها استفاده شود.
● علم مواد: مجموعهٔ نرمافزاری Schrodinger Suite میتواند برای شبیهسازیهای خواص مواد مانند رسانایی، سختی و نقطه ذوب با استفاده از روشهای شبیهسازی مانند دینامیک مولکولی و نظریهٔ تابعی چگالی استفاده شود.